琼脂糖(Agarose),不含DNase、RNase和Protease。配制成的琼脂糖凝胶的凝固点为34~38℃,熔点为87~89℃。常用于配制核酸分析凝胶,例如用于DNA或RNA电泳的琼脂糖凝胶等。常使用TAE或TBE作为电泳液。
琼脂糖凝胶的浓度和DNA电泳的分辨率及理想的电泳液参考下表。对于分辨率要求不高时,使用TAE(Tris-乙酸EDTA缓冲液)和TBE(Tris-硼酸EDTA缓冲液)均可;对于分辨率要求比较高时,较低浓度的胶有利于提高大分子量核酸的分辨率,此时宜使用TAE;而较高浓度的胶有利于提高小分子量核酸的分辨率,此时宜使用TBE。
胶浓度(w/v) |
分离范围 (bp) | 电泳液 |
0.8% | 800~22,000 | TAE |
1.0% |
500~10,000 | TAE/TBE |
1.2% | 400~7,000 | TAE/TBE |
1.5% | 250~5,000 | TAE/TBE |
2.0% | 15~3,000 | TBE |