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基因组De novo测序，也叫从头测序，即对未知基因组序列或无近源物种基因组信息的某个物种的基因组DNA片段及其文库进行测序，然后用生物信息学方法进行拼接、组装和注释，并对其进行结构和功能研究，尽可能地获得该物种的基因组序列图谱，从而推动该物种的后续研究。真核（真菌）和原核生物（细菌）基因组结构存在较大差异，组装方式和注释数据库有所不同，将单菌全基因组测序分为细菌基因组测序和真菌基因组测序。

细菌基因组De novo测序已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制，关键功能基因的重要工具，可以预测重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制；在研究病原菌的致病性与疾病的预防和治疗方面，可以鉴定致病相关基因、开发和研究疫苗、开发新型抗生素等；在研究细菌进化方面，可以研究种内进化关系。

平台优势

除久经考验的Illumina HiSeq平台外，基于单分子成像技术的BioNano平台，为基因组de novo组装和染色体结构变异提供了全新的研究方法。PacBio RS单分子实时测序系统，无需PCR扩增，测序覆盖深度不受序列中 GC含量差异影响及其无与伦比的长序列读长等优势为合作伙伴提供优质的基因组组装等技术服务。

技术优势

高精度：基因组检测成为细菌鉴定产业的金标准。

高效运作：经典案例团队打造，兼顾商业合作、科研合作优势。

研究内容

一、基因组组装

二、基因组组分分析

1)  基因成分；

2)  重复序列；

3)  非编码RNA；

4)  CRISPR；

5)  前噬菌体；

6)  基因岛。

三、基因功能分析

1)  通用功能注释(默认KEGG、SwissProt、GO，可选Nr，COG)；

2)  动物病原细菌致病性和耐药性分析（适用动物病原细菌）；

3)  植物病原细菌致病性分析（适用植物病原细菌）。

四、信息挖掘推荐

五、比较基因组分析（需要参考序列）

1)  结构变异（共线性）；

2)  共有基因和特有基因；

3)  物种进化（基于共有基因和特有基因或基因家族构建系统进化树）；

4)  基因家族。