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Small RNA是生命活动重要的调节因子，包括miRNA、piRNA和siRNA。在 mRNA 的转录及转录后水平的调控中发挥重要作用，参与细胞生长、分化、代谢等各个生物学过程，对生物体的正常发育和疾病过程起着关键作用。Small RNA 测序是指基于高通量测序平台对目标样本的small RNA 进行大规模检测，同时发现新的小 RNA，结合生物信息学挖掘手段，研究 small RNA 的功能、结构和调控机制。

利用HiSeq或BGISEQ-500平台，对富集到的18-30nt的小RNA片段进行测序，对获得的有效数据进行序列长度分布统计，将筛选后的高质量序列分类注释，从而获得样品中包含的各组分及表达量信息，并对所有小RNA片段进行注释，对miRNA进行靶基因预测等分析。

一、标准分析
1、数据产出统计，对原始信息采集数据去接头污染，去低质量reads         

2、18-30 nt Small RNA 信息采集结果的长度分布         

3、Small RNA在选定的参考基因组上的分布(只能选定一个参考基因组)

4、Small RNA分类注释

① Small RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比对信息   

② Small RNA与重复序列的比对信息

③ Small RNA与exon/intron的比对信息    

④ Small RNA与miRBase中指定范围的已知的miRNA的比对

⑤ miRNA家族分析

⑥ 动物保守piRNA注释分析(分析仅针对数据库中已有的物种：人、小鼠、斑马鱼、线虫、果蝇、大鼠、鸡、家蚕)

5、Small RNA预测(miRNA/siRNA/piRNA)

6、已知和新Small RNA 定量分析(miRNA/siRNA/piRNA)

7、已知和新Small RNA差异表达分析(miRNA/siRNA/piRNA)

8、已知和新miRNA表达/差异表达聚类分析

9、Small RNA 靶基因预测(miRNA/siRNA/piRNA)

10、差异Small RNA 靶基因GO 注释和KEGG 通路分析
二、定制化信息分析

可结合客户的材料与需求，协商确定定制化信息分析内容。