利用LC-MS/MS技术鉴定单一胶条(SDS-PAGE)、IP/Co-IP/Pull-down纯化溶液等中等复杂样本的蛋白。
Insect Sci. 2012. 12: p. 18. Nature reviews Molecular cell biology, 2007. 8(8): p. 645-654.
混合物鉴定
基础类产品:适用于中等复杂的样本,鉴定结果可以作为研究蛋白互作的数据基础
仪器性能优良:基于高分辨率(大于105)、高质量精度(小于1ppm)质谱平台,可获得更加准确的结果
鉴定数:一般可鉴定10~300种蛋白
信息分析内容
数据产出统计
蛋白质鉴定结果
蛋白质GO分析
蛋白质COG分析
蛋白质Pathway代谢通路分析
混合物样本:≥30µg,浓度≥1µg/µl
胶条样本:考染或银染条带肉眼可见,条带清晰。银染胶不能含有戊二醛,且须在电泳后一周内切胶送样
Q Exactive, Thermo TripleTOF 5600,AB SCIEX
LTQ Orbitrap velos, Thermo
Methoprene and temperature effects on caste differentiation and protein composition in the Formosan subterranean termite, Coptotermesformosanus
J Insect Sci. 2012;12:18. doi: 10.1673/031.012.1801.
研究内容:
本次研究通过LC-MS/MS鉴定SDS-PAGE分离的蛋白,鉴定温度变化和甲氧普林处理后蛋白水平的变化,研究其对白蚁等级分化的影响。
研究路线:
样本:乳白蚁,分别经5种温度(20, 23, 25, 28, 31℃)处理,以及有无甲氧普林处理。
技术:SDS-PAGE分离蛋白,切取胶条进行质谱鉴定,并结合N端测序和凝胶观察结果,计算蛋白表达量,统计分析差异蛋白。
研究结果:
白蚁等级分化过程受到温度变化的调控,较高温度环境中,能更快地从工蚁发育成兵蚁
通过胶条鉴定和N端测序发现了多种蛋白应激变化,特别是这4种蛋白:Hexamerin-1,Hexamerin-2,Endo-beta 1, 4 glucanase和myosin
其中蛋白Hexamerin-2,Endo-beta 1, 4 glucanase和myosin的表达受温度、监测时间和保幼激素甲氧普林的影响。而Hexamerin-1主要表现对温度和监测时间的依赖效应
实验结果有利于理解控制白蚁分化的一系列复杂因素以及给消灭白蚁时提高保幼激素利用效率提供参考数据