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实验百宝箱-蛋白篇-酵母双杂

时间:2020-01-11| 作者:Admin

酵母感受态细胞的制备及质粒的转化

(1)    抽提BD和AD的相关质粒(浓度最好在100-200ng/μL);

(2)    预先灌制好需要的平板及各种培养基;

(3)   酵母感受态的制备:

1)           将酵母菌株(AH109或者是其他的菌株)在YPDA培养基平板上划线,30℃倒置培养3天左右,直到克隆大小为2-3mm;

2)           挑取一个酵母克隆于7.5ml的YPDA液体培养基中(50ml灭菌的离心管),30℃并且振荡(转速200rpm)培养24h左右;

3)           将这7.5ml菌液接入大体积(体积视转化个数确定)YPDA液体培养基中6h左右,30℃  200rpm 振荡培养;

4)           室温4000rpm离心5min以收集菌体,倒去上清并用40ml无菌去离子水重悬酵母;

5)           室温4000rpm离心5min以收集菌体,倒去上清并用3ml 1.1×TE/LiAc溶液重悬酵母;

6)           将重悬液分装为2个1.5ml的离心管,4000rpm离心1min;

7)           倒去上清,并将酵母重悬于600ul1.1×TE/LiAc溶液;

8)           在一个1.5ml灭菌的干净离心管中加入以下组分;

10ul herring testes carrier DNA (使用前在95°C水浴锅中变形10分钟,立即放在冰上5min,以后使用,就不需要变性),具体设置的实验如下:

实验组

阴性对照1

阴性对照2

用量

1

BK-bait

pGBKT7

BK-bait

0.2ug

2

AD-prey

AD-prey

pGADT7

0.1ug

 9) 将100ul 感受态细胞加入到DNA中;

10)加入600ul PEG/LiAc solution 快速彻底的混匀;

11) 放置于30℃并且振荡(转速200rpm)培养30分钟;

12) 每管加入70μl DMSO,轻轻上下颠倒混匀,42℃水浴热激15分钟;

13) 冰浴2分钟, 4000rpm,2分钟离心收集菌体,弃上清;

14)用500ul TE(PH 8.00)重悬菌体,离心4000rpm,2分钟离心收集菌体,弃上清,最后用50ul TE重悬菌体涂布于相应的SD-Trp/-Leu固体平板上,30℃ 倒置培养 3天左右,直到长出所需大小的克隆;

15)挑取平板上大小合适的克隆,并在700ul的SD-Trp/-Leu液体培养基中30℃震荡过夜培养,然后按1:10,1:100,1:1000的稀释比转移到SD-Trp/-Leu/-His及SD-Trp/-Leu/-His/-Ade固体培养基上培养,大约2天左右即可看到菌落的生长情况

16)对于在SD-Trp/-Leu/-His或者是SD-Trp/-Leu/-His/-Ade培养基上生长良好,而阴性对照没有生长的平板可以照相保存(若有由于His渗漏表达造成的背景杂菌,可在培养基中加入1mM  3-AT进行抑制)。

酵母相关试剂的配制:

1    YPD培养基(1L)

PEPTONE                 20g

Yeast extract               10g

加ddH2O 溶解后,定容至1L,并用KOH调PH至5.80,(若为固体加入Agar  20g),高压灭菌。如要铺置平板,则在稍冷却后加入40%的葡萄糖溶液(终浓度2%)。

1 2.     YPDA培养基(1L)

1L YPD液体培养基中加入15ml 0.2%Adenine hemisulfate 溶液(终浓度为0.03%)

1 3.     SD-Trp/-Leu和SD-Trp/-Leu/-His培养基的配置(1L)

Minimal SD base(Clontech)    26.7g

SD--Trp/-Leu    0.64g,SD-Trp/-Leu/-His   0.62g及SD-Trp/-Leu/-His/-Ade   0.60g

加水溶解并定容至1L,并且调pH到5.80,若为固体培养基则加入20g Agar(终浓度2%),并高压灭菌(121°C 灭菌15min)

1 4.      1.1 ×TE/LiAc

现配现用:1.1ml  10×TE和1.1ml 1M  LiAc ,用无菌去离子水补充至10ml。

1 5.      PEG/ LiAc

现配现用:1ml  10×TE和1ml 1M  LiAc ,然后用50% PEG3350 溶液补至10ml

 

注意问题:

1 做酵母时,1.1 ×TE/LiAc,PEG/ LiAc混合溶液都需要现配现用;

2 当目的蛋白在LT长得比较少,可考虑提高酵母感受态的浓度;

3 在加入DMSO以后,切记不要剧烈的震荡,否则影响感受态的效率;

4 所有的步骤都是在超净台中进行,防止其他杂菌污染;

5 SD--Trp/-Leu,SD-Trp/-Leu/-His 及SD-Trp/-Leu/-His/-Ade 加水溶解并定容至1L,并且调pH到5.80,务必要调节pH,否则到时候涂板时,后出现培养基很松软,导致涂板时,培养基破裂变成渣渣,耽误实验;


  6.当目的蛋白出现自激活时,有以下解决方法:

    1)   加入一定浓度的3AT(如1mM);

    2)   如果目的蛋白在AD上有自激活,就换到BD那一边;

    3) 可以放在25°C培养;

    4) 如果还是解决不了,考虑截短目的蛋白。

 

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